厚生労働省は４月７日までに、感染症週報・第12週（３月17～23日）を発表。第４週（１月20～26日）の定点当たり38.7から徐々に減少し、この週は7.10になった。これまで減少のスピードは緩やかだったが、第11週（9.84）から大幅マイナスとなった。西日本の一部などで感染者が前週を上回る地域が見られたが、この週は長崎（5.14⇒6.67）だけだった。今シーズン分離された病原体はＡ香港型（H3N2）が大半を占めるが、Ｂ型の分離も報告されている。Ａソ連型（H1N1）の分離報告はまだない。ピークの第４週前後を過ぎてから、数週間後に第２のピークを迎えた地域は、Ｂ型による小流行と見られる。これとは別に同省が学校での休校、学級閉鎖の状況などをまとめたインフルエンザ様疾患発生報告・第19週（３月23～29日）によると、この週の新たな休校、学年閉鎖、学級閉鎖はシーズン入りの第１週以来初めてゼロとなった。